Les Ninjas sont répartis selon une hiérarchie bien précise:

Étudiant de l'académie Ninja:
Un étudiant est un jeune en apprentissage de Ninja à l'académie afin d'apprendre les bases de la théorie et de la pratique. A la fin de leur apprentissage, ils passent un petit examen leurs permettant, en cas de succès, de passer au rang d'Aspirant Ninja, et de recevoir la preuve de leur promotion: le bandeau frontal de Ninja au motif de leurs village.

Genin:
Les nouveaux aspirants sont répartis par équipes de trois et placés sous la responsabilité d'un Jounin (voir ci-après) qui leur fait passé un nouveau test, de son propre invention. Si ils réussissent le test en question, les aspirants passent au rang de Genin, mais si ils échouent, ils retournent à l'académie pour un an au minimum. Les équipes ayant réussi le test imposé par leur jounin deviennent permanentes, et peuvent se voir attribuer des missions. Leur jounin, qui jusque là était leur professeur, devient leur chef d'équipe.

Chuunin:
Environ une fois tous les six mois, les jounins se rassemblent et nomment les membres de leur équipe qu'ils estiment aptes à passer l'examen chunin. L'examen chunin rassemble les meilleurs Genins de chaque village Ninja en un grand tournois précédé de diverses épreuves éliminatoires. Les Genins le passant avec succès passent au rang de Chunin. Les Chunins sont, pour la plupart, nommés enseignants à l'académie. Mais ils peuvent également faire office de chef d'équipe si aucun jounin n'est disponible.

Juunin:
Les jounins sont des Ninjas particulièrement brillants, nommés par leur Kage comme étant l'élite (officielle) du village. Ils sont généralement nommés comme chef d'équipe, mais peuvent aussi se voir attribuer des missions en solo. Certains sont même attachés à la formation des ANBU .

ANBU:
Les Anbu sont des Ninjas spéciaux, une élite formée par les meilleurs juunins ou par le Kage lui-même, pour s'occuper de toutes les missions exigeant une certaine discrétion, efficacité, et dont le Kage n'a pas le temps de s'occuper pesonnellement. Ils sont également attachés à la sécurité globale du village et dans la traque des déserteurs .Ils forment aussi la garde personnelle du Kage.

Sannin:
Pour résumer (et contrairement à ce que certains pensent...), les sannin ne sont pas forcément des Ninjas incroyablement forts, sont appellés " sannin " les élèves personnels du Kage. D'ailleurs Sannin veut dire " Trois Personnes ", rien de plus.

Déserteurs:
Il s'agit là plus d'un statut que d'un grade. Les déserteurs sont des Ninjas ayant fuis leur village natal pour diverse raisons (trahison, bannissement, ...)Ils ont en général le même niveau que des Chunnins ou Jounnins et sont sans cesse traqués par les anbus chasseur de déserteur. On reconnaît un Ninja déserteur à son bandeau ou le signe de son village barré. Certains déserteurs font partie de l organisation Akatsuki qui regroupe les meilleurs déserteurs du monde, ils sont extrêmement puissant et leur niveau est comparable a celui des Sannins voir de Kages. (Orochimaru à tué deux Kages à lui tout seul^^).

Kage:
Le titre de Kage est attribué au Ninja le plus puissant et le plus sage du village afin de le diriger en y devenant le chef. Il y a un Kage dans chaque village et ils portent tous une longue cape et un chapeau avec l'élément de leur pays. Il ne peut y avoir seulement cinq Kage dans le monde (sauf exceptions, comme par exemple deux Kage régnant en même temps dans un même village, chose tout à fait exceptionnel). Voici les 5 Kage existant:

• Hokage (chef du village de Konoha)
• Kazekage (chef du village du sable)
• Mizukage (chef du village du brouillard)
• Tsuchikage (chef du village des roches)
• Raikage (chef du village des nuages)